В целях защиты населения и территорий Кыргызской Республики 1 июля 1991 года Кабинетом Министров Республики Кыргызстан (еще в составе СССР) принято постановление о создании Государственной комиссии по чрезвычайным ситуациям. С момента создания Государственной комиссии по чрезвычайным ситуациям в качестве приоритетных принципов ее деятельности выбран мониторинг опасных природных процессов и прогнозирование чрезвычайных ситуаций. За годы становления Департамента мониторинга, произошли следующие позитивные институциональные преобразования:
1992-1994 гг. Центр наблюдения и защиты ГКЧС;
1994-1996 гг. Отдел наблюдения и защиты ГКЧС
1996-1997 гг. Отдел мониторинга природных, техногенных процессов и явлений в составе аппарата МЧС и ГО КР;
1997-1999 гг. Управление мониторинга опасных природных, техногенных процессов и явлений МЧС и ГО;
1999-2001 гг. Центр мониторинга опасных природных, техногенных процессов и реабилитации хвостохранилищ и горных отвалов МЧС и ГО;
2001-2002 гг. Департамент мониторинга, прогнозирования чрезвычайных ситуаций и обращения с хвостохранилищами МЭ и ЧС;
В связи с тем, что более 80% чрезвычайных ситуаций происходит на юге Кыргызской Республики, в 2002 году в структуре Департамента было создано Южное управление Департамента мониторинга.
2002-2009 гг. Департамент мониторинга, прогнозирования чрезвычайных ситуаций и обращения с хвостохранилищами МЧС КР;
В соответствии Постановлением Правительства КР от 20.02.2008 г. №55 «О передислокации Министерства чрезвычайных ситуаций Кыргызской Республики в г. Ош» в связи с передислокацией МЧС КР в г. Ош для концентрации и координации усилий, направленных на предупреждение и ликвидации природных и техногенных явлений на основании приказа МЧС КР № 241 от 25 марта 2008 года Департамент мониторинга, прогнозирования чрезвычайных ситуаций и обращения с хвостохранилищами передислоцирован в город Ош.
Согласно Постановления Правительства Кыргызской Республики №731 от 04.12.2009 года «О Министерстве чрезвычайных ситуаций Кыргызской Республики» с мая 2010 г преобразован в Департамент мониторинга и прогнозирования чрезвычайных ситуаций МЧС КР.
Положение о Департаменте мониторинга, прогнозирования чрезвычайных ситуаций Министерства чрезвычайных ситуаций Кыргызской Республики Утверждено постановлением Правительства Кыргызской Республики от “ 5 ” марта 2010 года №130.
